Jedním z bodů navrhované reformy vysokého školství, proti které protestují některé studentské iniciativy a vysokoškolští pedagogové, je údajná hrozba politizace vysokých škol a ohrožení akademických svobod.
Ministr Josef Dobeš chce v čele univerzity silného rektora, který by měl školu manažersky řídit. Pomáhat by mu měla Rada VŠ. Třetinu jejích členů by nominoval akademický senát, třetinu rektor a třetinu ministr.
A někteří studenti a pedagogové se například obávají, že ministr by v budoucnu mohl nominovat do rady účelově - politiky či byznysmeny.








